تحليل المجموعات الهرمية باستخدام المسافات الإقليدية

Offered By
In this Guided Project, you will:

فهم أهمية واستخدام المجموعات الهرمية باستخدام ملفات تخصيص الانحراف.

تحدد موقع ملفات الجينوم الفيروسي (cDNA) ومعالجتها لحساب ملفات تعريف الانحراف.

فهم نظرية استخدام معادلة فيثاغورس لحساب المسافة الإقليدية. وتطبيق ذلك باستخدام بايثون لبناء مصفوفة ربط.

ساعاتين
Intermediate
No download needed
Split-screen video
Arabic
Desktop only

بنهاية هذا المشروع ، ستنشئ برنامج Python باستخدام واجهة jupyter لتحليل مجموعة من الفيروسات وترسم مخططًا شجرياً أو دندوجرام بناءً على أوجه التشابه فيما بينها. سيعتمد الدندوجرام الذي ستقوم بإنشائه على ملف تعريف الانحراف التراكمي، والذي يعتمد بدوره على تركيبة النوكليوتيدات. ستستخدم تسلسل الجينوم الكامل للعديد من الفيروسات بما في ذلك، كورونا، وفيروس السارس، وفيروس نقص المناعة البشرية، وزيكا، وحمى الضنك، والفيروس المعوي، وفيروسات غرب النيل. ملاحظة: تعمل هذه الدورة التدريبية بشكل أفضل للمتعلمين المقيمين في منطقة أمريكا الشمالية. نعمل حاليًا على توفير نفس التجربة في مناطق أخرى.

Skills you will develop

  • Python Programming

  • Genomics

  • plotting

Learn step-by-step

In a video that plays in a split-screen with your work area, your instructor will walk you through these steps:

  1. الخطوة الأولى: مقدمة (توسيع تحليل الانحراف)

  2. الخطوة الثانية: تحديد موقع ملفات البيانات ومعالجتها

  3. الخطوة الثالثة: استيعاب البيانات. فهم مجموعة البيانات الناتجة والتعامل معها

  4. الخطوة الرابعة: التجميع الهرمي - (المقياس - Metric)

  5. الخطوة الخامسة: التجميع الهرمي - (الترتيب والطرق Ordering & Methods)

  6. الخطوة الساسدسة: رسم المخطط الشجري (dendrogram)

  7. الخطوة السابعة: تحليل المخطط الشجري (dendrogram)

  8. الخطوة الثامنة: أخطاء يجب تجنبها

How Guided Projects work

Your workspace is a cloud desktop right in your browser, no download required

In a split-screen video, your instructor guides you step-by-step

Frequently Asked Questions

By purchasing a Guided Project, you'll get everything you need to complete the Guided Project including access to a cloud desktop workspace through your web browser that contains the files and software you need to get started, plus step-by-step video instruction from a subject matter expert.

Because your workspace contains a cloud desktop that is sized for a laptop or desktop computer, Guided Projects are not available on your mobile device.

Guided Project instructors are subject matter experts who have experience in the skill, tool or domain of their project and are passionate about sharing their knowledge to impact millions of learners around the world.

You can download and keep any of your created files from the Guided Project. To do so, you can use the “File Browser” feature while you are accessing your cloud desktop.

Guided Projects are not eligible for refunds. See our full refund policy.

Financial aid is not available for Guided Projects.

Auditing is not available for Guided Projects.

At the top of the page, you can press on the experience level for this Guided Project to view any knowledge prerequisites. For every level of Guided Project, your instructor will walk you through step-by-step.

Yes, everything you need to complete your Guided Project will be available in a cloud desktop that is available in your browser.

You'll learn by doing through completing tasks in a split-screen environment directly in your browser. On the left side of the screen, you'll complete the task in your workspace. On the right side of the screen, you'll watch an instructor walk you through the project, step-by-step.