When will I have access to the lectures and assignments?

To access the course materials, assignments and to earn a Certificate, you will need to purchase the Certificate experience when you enroll in a course. You can try a Free Trial instead, or apply for Financial Aid. The course may offer 'Full Course, No Certificate' instead. This option lets you see all course materials, submit required assessments, and get a final grade. This also means that you will not be able to purchase a Certificate experience.

What will I get if I subscribe to this Specialization?

When you enroll in the course, you get access to all of the courses in the Specialization, and you earn a certificate when you complete the work. Your electronic Certificate will be added to your Accomplishments page - from there, you can print your Certificate or add it to your LinkedIn profile.

Is financial aid available?

Yes. In select learning programs, you can apply for financial aid or a scholarship if you can’t afford the enrollment fee. If fin aid or scholarship is available for your learning program selection, you’ll find a link to apply on the description page.

Engineering Genetic Circuits: Design

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Engineering Genetic Circuits: Design

Ce cours fait partie de Spécialisation "Engineering Genetic Circuits"

Instructeurs : Chris Myers

5 124 déjà inscrits

Inclus avec

5 modules

Obtenez un aperçu d'un sujet et apprenez les principes fondamentaux.

37 avis

niveau Débutant

Expérience recommandée

Planning flexible

2 semaines à 10 heures une semaine

Apprenez à votre propre rythme

Préparer un diplôme

5 modules

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Ce que vous apprendrez

Identify the different types of cells, their components, and structure.
Discover the underlying structure of devices and their connection to genetic parts.
Contrast different experimental techniques used in genetic construction.
Evaluate the different principles used in genetic circuit design.

Compétences que vous acquerrez

Catégorie : Design Specifications
Catégorie : Technical Standard
Catégorie : Life Sciences
Catégorie : Biological Engineering
Catégorie : Technical Design
Catégorie : Biochemistry
Catégorie : Biotechnology
Catégorie : Systems Design
Catégorie : Molecular Biology
Catégorie : Computational Logic
Catégorie : Biology
Catégorie : Laboratory Research
Catégorie : Molecular, Cellular, and Microbiology
Catégorie : Process Engineering
Catégorie : Laboratory Experience
Catégorie : Research Design
Catégorie : Diagram Design
Catégorie : Cell Biology
Catégorie : Engineering Design Process

Détails à connaître

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Évaluations

10 devoirs

Enseigné en Anglais

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Ce cours fait partie de la Spécialisation "Engineering Genetic Circuits"

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Il y a 5 modules dans ce cours

This course gives an introduction to the biology and biochemistry necessary to understand genetic circuits. It starts by providing an engineering viewpoint on genetic circuit design and a review of cells and their structure. The second module introduces genetic parts and the importance of standards followed by a discussion of genetic devices used within circuit design. The last two modules cover experimental techniques and construction methods and principles applied during the design process.  

Détails du module

This week gives a brief introduction to the biology and biochemistry necessary to understand genetic circuits. The material covered is only a basic overview, since it is usually the topic of whole courses. It should, however, give the grounding necessary to begin studying the modeling, analysis, and design of genetic circuits.

Inclus

8 vidéos5 lectures3 devoirs

8 vidéosTotal 119 minutes

What is Systems Biology?10 minutes
The Phage Lambda Example14 minutes
What is Synthetic Biology?9 minutes
A Brief History of Synthetic Biology23 minutes
Cells and Viruses16 minutes
Macromolecules18 minutes
Genomes12 minutes
Genetic Circuits16 minutes

5 lecturesTotal 66 minutes

Course Updates and Accessibility Support1 minute
Non-Credit Students: Welcome and Where to Find Help10 minutes
Adventures in Synthetic Biology10 minutes
A Brief History of Synthetic Biology30 minutes
Engineering Genetic Circuits - Chapter 1 (Section 1.1 to 1.6)15 minutes

3 devoirsTotal 55 minutes

Instructions on accessing reading materials5 minutes
Brief Introduction to Biochemistry20 minutes
Introduction to Synthetic Biology30 minutes

This week highlights the importance of standards in synthetic biology as an engineering discipline. Furthermore, the week introduces genetic parts - the basic building used to construct genetic circuits.

Inclus

17 vidéos10 lectures3 devoirs

17 vidéosTotal 121 minutes

Sequence Ontology6 minutes
SBOL Visual8 minutes
Standard Parts3 minutes
Data Repositories19 minutes
FASTA and GenBank Standards5 minutes
SBOL Data Model Overview3 minutes
SBOL Data Model Details20 minutes
SBOL Data Model Advanced Elements6 minutes
Conversion of iGEM dataset4 minutes
Comparison of Data Standards2 minutes
Promoters10 minutes
Operator Sites21 minutes
Ribosome Binding Sites4 minutes
Protein Coding Regions2 minutes
Terminators2 minutes
SynBioHub Tutorial3 minutes
Excel2SBOL Tutorial3 minutes

10 lecturesTotal 265 minutes

Sequence Ontology30 minutes
SBOL Visual15 minutes
SynBioHub15 minutes
SBOLme15 minutes
JBEI ICE30 minutes
SBOL Version 130 minutes
SBOL Version 230 minutes
SBOL Version 330 minutes
Engineering Genetic Circuits - Chapter 1 (Section 1.7)10 minutes
Common Genetic Parts60 minutes

3 devoirsTotal 45 minutes

Resources15 minutes
SBOL Data Model15 minutes
Genetic Part Selection15 minutes

This week introduces genetic devices, the aggregation of multiple genetic parts. Basic rules for composing, as well as different types of devices, are introduced, as well.

Inclus

11 vidéos2 lectures2 devoirs1 évaluation par les pairs

11 vidéosTotal 74 minutes

Basic Rules of Devices8 minutes
Types of Devices10 minutes
Biological Logic Gates3 minutes
Genetic Inverter and Oscillator7 minutes
Basic Biological Logic Gates6 minutes
Chemical Inducer and One Gene Logic Gates4 minutes
Sequential Logic Circuits5 minutes
Genetic Toggle Switch6 minutes
Genetic Muller C-Element12 minutes
Genetic Circuit Design Challenges7 minutes
SBOLCanvas Tutorial8 minutes

2 lecturesTotal 20 minutes

Engineering Genetic Circuits - Chapter 7 (Sections 7.1 to 7.3)10 minutes
Engineering Genetic Circuits - Chapter 7 (Sections 7.4 to 7.5)10 minutes

2 devoirsTotal 25 minutes

Basic device rules15 minutes
Genetic Logic Identification10 minutes

1 évaluation par les pairsTotal 60 minutes

Genetic Device Design60 minutes

This week introduces techniques used to construct a genetic circuit. This includes commonly used methods like polymerase chain reaction for cloning and DNA assembly methods. Finally, construction methods to assemble different genetic parts are presented.

Inclus

7 vidéos7 lectures1 devoir1 évaluation par les pairs

7 vidéosTotal 39 minutes

Gene Cloning and Polymerase Chain Reaction6 minutes
Vectors and Plasmids3 minutes
DNA Assembly methods1 minute
BioBrick Standard Assembly11 minutes
Golden Gate Assembly7 minutes
End Homology Methods4 minutes
DNA Synthesis6 minutes

7 lecturesTotal 109 minutes

PCR Demonstration4 minutes
Molecular Cloning30 minutes
Polymerase Chain Reaction30 minutes
BioBrick Standard Assembly10 minutes
Golden Gate Assembly20 minutes
Gibson Assembly10 minutes
SBOLDesigner and Benching Tutorial5 minutes

1 devoirTotal 15 minutes

Experimental Techniques15 minutes

1 évaluation par les pairsTotal 60 minutes

Genetic Construction Planning60 minutes

This week introduces practical challenges in realizing genetic circuit designs.

Inclus

5 vidéos2 lectures1 devoir

5 vidéosTotal 43 minutes

Introduction9 minutes
Failure Modes13 minutes
Context Issues7 minutes
Alternative Genetic Circuit Design Styles10 minutes
The Road Ahead4 minutes

2 lecturesTotal 60 minutes

Principles of Genetic Circuit Design30 minutes
Computational Synthetic Biology: Progress and the Road Ahead30 minutes

1 devoirTotal 15 minutes

Potential Genetic Design Problems15 minutes

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Préparer un diplôme

Ce site cours fait partie du (des) programme(s) diplômant(s) suivant(s) proposé(s) par University of Colorado Boulder. Si vous êtes admis et que vous vous inscrivez, les cours que vous avez suivis peuvent compter pour l'apprentissage de votre diplôme et vos progrès peuvent être transférés avec vous.¹