In this 1-hour long project-based course, you will learn how to access, parse, and visualize data from various bioinformatics sequence and structural online databases such as ENTREZ, PDB, KEGG and NCBI using Biopython.
Access Bioinformatics Databases with Biopython
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Access Bioinformatics Databases with Biopython
Dozent: Bhagesh Hunakunti
4.591 bereits angemeldet
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Erwerben Sie praxisrelevante Kompetenzen unter Anleitung von Experten, üben Sie sich in ihrer Anwendung und wenden Sie sie schließlich an.
4.5
(47 Bewertungen)
Stufe Mittel
Empfohlene Erfahrung
1 hour
In Ihrem eigenen Lerntempo lernen
Praktisches Lernen
Was Sie lernen werden
Sequence alignment using NCBI-BLAST
Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ, PDB, EXPASY
Access KEGG pathways and genes
Kompetenzen, die Sie festigen
- Kategorie: File I/O
- Kategorie: Data Visualization
- Kategorie: Extensible Languages and XML
- Kategorie: Scientific Visualization
- Kategorie: Bioinformatics
- Kategorie: Data Manipulation
- Kategorie: Data Access
Tools, die Sie verwenden werden
- Kategorie: Database Software
- Kategorie: Python Programming
- Kategorie: Extensible Markup Language (XML)
Wichtige Details
Zertifikat zur Vorlage
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Unterrichtet in Englisch
Keine Downloads oder Installation erforderlich
Nur als Desktop-Version verfügbar
Erfahren Sie, wie Mitarbeiter führender Unternehmen gefragte Kompetenzen erwerben.
Lernen, Üben und Anwenden von berufsrelevanten Fähigkeiten in weniger als 2 Stunden
- Nehmen Sie an Schulungen von Branchenexperten teil
- Sammeln Sie mit Aufgaben aus der realen Welt praktische Erfahrung
- Schaffen Sie Vertrauen durch neueste Tools und Technologien
Über dieses begleitete Projekt
Schritt für Schritt lernen
In einem Video, das auf einer Hälfte Ihres Arbeitsbereichs abgespielt wird, führt Sie Ihr Dozent durch diese Schritte:
Sequence alignment using NCBI-BLAST
Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ
Fetch proteins from PDB
PROSITE & SCANPROSITE from EXPASY
Access KEGG database
Empfohlene Erfahrung
Bioinformatics, Python programming
3 Projektbilder
Dozent
1 Kurs4.591 Lernende
von
Was Sie beim Lernen erwartet
Auf Kompetenzen basierendes, praktisches Lernen
Üben Sie die Anwendung neuer Kompetenzen anhand von berufsbezogenen Aufgabenstellungen.
Anleitung durch Experten
Lernen Sie mit vorab von Experten aufgezeichneten Videos in einer einzigartigen aufgeteilten Oberfläche.
Keine Downloads oder Installation erforderlich
Greifen Sie in einem vordefinierten Cloud-Arbeitsbereich auf die Tools und Ressourcen zu.
Nur für Desktop verfügbar
Dieses begleitete Projekt ist für die Bearbeitung an einem Laptop oder Desktop-Computer mit stabiler Internetverbindung konzipiert und nicht für Mobilgeräte.
Warum entscheiden sich Menschen für Coursera für ihre Karriere?
Felipe M.
Lernender seit 2018
„Es ist eine großartige Erfahrung, in meinem eigenen Tempo zu lernen. Ich kann lernen, wenn ich Zeit und Nerven dazu habe.“
Jennifer J.
Lernender seit 2020
„Bei einem spannenden neuen Projekt konnte ich die neuen Kenntnisse und Kompetenzen aus den Kursen direkt bei der Arbeit anwenden.“
Larry W.
Lernender seit 2021
„Wenn mir Kurse zu Themen fehlen, die meine Universität nicht anbietet, ist Coursera mit die beste Alternative.“
Chaitanya A.
„Man lernt nicht nur, um bei der Arbeit besser zu werden. Es geht noch um viel mehr. Bei Coursera kann ich ohne Grenzen lernen.“
Bewertungen von Lernenden
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DF
Geprüft am 4. Apr. 2023
While the walkthrough of how to use Bio[ython was very informative, I wished that the quiz was more in depth on reusing the programs that were just written.
MD
Geprüft am 29. Juni 2021
Great, thanks alot. I really enjoyed the project. I can use and expand my knowledge using this codes on my own.
SB
Geprüft am 11. Dez. 2024
Gives a good understanding of different bioinformatics tools using the Python biopython package. This knowledge works as a very good foundation for someone willing to gain deep knowledge in the field.
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