Ce cours propose des démonstrations et des exercices permettant d'effectuer des tâches courantes d'analyse de données de séquences bactériennes basées sur la génomique. Il utilise BV-BRC, le Bacterial and Viral Bioinformatics Resource Center (fusion de PATRIC, IRD et ViPR, les trois anciennes ressources), comme plateforme d'analyse. BV-BRC est le centre de ressources bioinformatiques bactériennes financé par le NIH/NIAID, qui fournit des données génomiques bactériennes complètes avec des outils d'analyse et de visualisation intégrés. BV-BRC fournit également un espace de travail privé où les utilisateurs peuvent télécharger et analyser leurs propres données. Les participants au cours acquerront les compétences nécessaires pour effectuer une analyse comparative des génomes bactériens, en commençant par les données de séquence brutes. Les leçons du premier module couvrent l'assemblage du génome, l'annotation, la construction de l'arbre phylogénétique et les comparaisons entre familles de protéines et protéomes. Les leçons du premier module couvrent l'assemblage du génome, l'annotation, la construction de l'arbre phylogénétique et les comparaisons entre familles de protéines et protéomes. NOTE : Les exercices de ce cours ont été développés à l'aide de PATRIC, le système prédécesseur de BV-BRC. Cependant, BV-BRC a été construit à partir de PATRIC, donc la plupart du contenu est encore le même.

Bioinformatique bactérienne

323 avis
Expérience recommandée
Ce que vous apprendrez
Apprenez à assembler un génome bactérien
Apprenez à annoter un génome bactérien
Apprenez à générer un arbre phylogénétique à partir d'un ensemble de génomes bactériens
Apprenez à effectuer des analyses comparatives de base d'un ensemble de génomes bactériens
Compétences que vous acquerrez
- Catégorie : Logiciel d'analyse de données
- Catégorie : Bioinformatique
- Catégorie : Taxonomie
- Catégorie : Importation/exportation de données
- Catégorie : Visualisation scientifique
Détails à connaître
8 devoirs
Découvrez comment les employés des entreprises prestigieuses maîtrisent des compétences recherchées

Il y a 8 modules dans ce cours
Instructeur

Offert par
En savoir plus sur Informatique de santé

Technical University of Denmark (DTU)

Birla Institute of Technology & Science, Pilani

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Avis des étudiants
- 5 étoiles
78,08 %
- 4 étoiles
16,35 %
- 3 étoiles
2,77 %
- 2 étoiles
1,54 %
- 1 étoile
1,23 %
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Révisé le 30 août 2026
one of the most informative and beneficial course i have ever learned
Révisé le 4 févr. 2022
i appreciate the dedication and design of the course. it so practical and friendly. thank You Dr. Rebecca.
Révisé le 27 oct. 2022
Very informative course content and I have learned a lot
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