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Lernen Sie neue Konzepte von Branchenexperten
Gewinnen Sie ein Grundverständnis bestimmter Themen oder Tools
Erwerben Sie berufsrelevante Kompetenzen durch praktische Projekte
Erwerben Sie ein Berufszertifikat zur Vorlage
In diesem Kurs gibt es 4 Module
Lernen Sie die Verwendung von Tools aus dem Bioconductor-Projekt zur Analyse genomischer Daten. Dies ist der fünfte Kurs im Rahmen der Genomic Big Data Specialization der Johns Hopkins University.
In diesem Kurs lernen Sie, wie Sie die Bioconductor-Software installieren und verwenden. Wir werden gängige Datenstrukturen wie ExpressionSets, SummarizedExperiment und GRanges besprechen, die bei verschiedenen Arten von Analysen verwendet werden.
Das ist alles enthalten
16 Videos3 Lektüren1 Aufgabe
Infos zu Modulinhalt anzeigen
16 Videos•Insgesamt 126 Minuten
R unter Windows installieren•3 Minuten
R auf einem Mac installieren•2 Minuten
Installieren von R Studio auf einem Mac•2 Minuten
Was ist Bioconductor•7 Minuten
Bioconductor installieren•4 Minuten
Die Bioconductor-Website•10 Minuten
Nützliche Online-Ressourcen•5 Minuten
R Basis-Typen•18 Minuten
GRanges - Überblick•5 Minuten
IRanges - Grundlegende Verwendung•12 Minuten
GenomicRanges - GRanges•9 Minuten
GenomicRanges - Grundlegende Verwendung von GRanges•8 Minuten
GenomicRanges - seqinfo•6 Minuten
AnnotationHub•8 Minuten
Anwendungsfall: AnnotationHub und GRanges, Teil 1•13 Minuten
Anwendungsfall: AnnotationHub und GRanges, Teil 2•14 Minuten
3 Lektüren•Insgesamt 30 Minuten
Willkommen•10 Minuten
Syllabus•10 Minuten
Umfrage vor dem Kurs•10 Minuten
1 Aufgabe•Insgesamt 30 Minuten
Quiz 1•30 Minuten
Zweite Woche
Modul 2•2 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In dieser Woche lernen wir, wie man biologische Sequenzen darstellt und berechnet, sowohl auf der Ebene des gesamten Genoms als auch auf der Ebene von Millionen von kurzen Reads.
Das ist alles enthalten
8 Videos1 Aufgabe
Infos zu Modulinhalt anzeigen
8 Videos•Insgesamt 81 Minuten
Biostrings•7 Minuten
BSgenome•7 Minuten
Biostrings - Abgleich•6 Minuten
BSgenome - Ansichten•9 Minuten
GenomicRanges - Rle•12 Minuten
GenomicRanges - Listen•6 Minuten
GenomicFeatures•19 Minuten
rtracklayer - Datenimport•15 Minuten
1 Aufgabe•Insgesamt 30 Minuten
Quiz 2•30 Minuten
Dritte Woche
Modul 3•2 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In dieser Woche werden wir uns mit grundlegenden Datentypen, ExpressionSet, biomaRt und R S4 beschäftigen.
Das ist alles enthalten
9 Videos1 Aufgabe
Infos zu Modulinhalt anzeigen
9 Videos•Insgesamt 79 Minuten
Grundlegende Datentypen•5 Minuten
Kommentar Übersicht•5 Minuten
ExpressionSet Übersicht•4 Minuten
ExpressionSet•10 Minuten
ZusammengefasstesExperiment•8 Minuten
GEO-Abfrage•7 Minuten
biomaRt•14 Minuten
R S4 Klassen•17 Minuten
R S4 Methoden•10 Minuten
1 Aufgabe•Insgesamt 30 Minuten
Quiz 3•30 Minuten
Vierte Woche
Modul 4•2 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In dieser Woche werden wir uns mit der Datenbeschaffung in Bioconductor, Rsamtools, Oligo, Limma und Minfi beschäftigen
Das ist alles enthalten
7 Videos1 Lektüre1 Aufgabe
Infos zu Modulinhalt anzeigen
7 Videos•Insgesamt 81 Minuten
Daten in Bioconductor übertragen•7 Minuten
Kurz gelesen•4 Minuten
Rsamtools•13 Minuten
oligo•14 Minuten
limma•17 Minuten
minfi•11 Minuten
Zählbasierte RNA-seq-Analyse•16 Minuten
1 Lektüre•Insgesamt 10 Minuten
Umfrage nach dem Kurs•10 Minuten
1 Aufgabe•Insgesamt 30 Minuten
Quiz 4•30 Minuten
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Dozent
Lehrkraftbewertungen
Lehrkraftbewertungen
Wir haben alle Lernenden um Feedback zu unseren Dozenten gebeten, ausgehend von der Qualität ihres Unterrichtsstils.
Die Aufgabe der Johns Hopkins University ist es, ihre Studenten auszubilden und ihre Fähigkeit zum lebenslangen Lernen zu fördern, unabhängige und originelle Forschung zu betreiben und der Welt den Nutzen von Entdeckungen zu bringen.
Warum entscheiden sich Menschen für Coursera für ihre Karriere?
Felipe M.
Lernender seit 2018
„Es ist eine großartige Erfahrung, in meinem eigenen Tempo zu lernen. Ich kann lernen, wenn ich Zeit und Nerven dazu habe.“
Jennifer J.
Lernender seit 2020
„Bei einem spannenden neuen Projekt konnte ich die neuen Kenntnisse und Kompetenzen aus den Kursen direkt bei der Arbeit anwenden.“
Larry W.
Lernender seit 2021
„Wenn mir Kurse zu Themen fehlen, die meine Universität nicht anbietet, ist Coursera mit die beste Alternative.“
Chaitanya A.
„Man lernt nicht nur, um bei der Arbeit besser zu werden. Es geht noch um viel mehr. Bei Coursera kann ich ohne Grenzen lernen.“
Bewertungen von Lernenden
3.8
386 Bewertungen
5 stars
42,22 %
4 stars
24,61 %
3 stars
15,54 %
2 stars
9,32 %
1 star
8,29 %
Zeigt 3 von 386 an
J
JK
4·
Geprüft am 30. Aug. 2016
I think it is a good class overall but the pace is fast and the resources that can help you is lacking. This will be good for someone who already kind of understands bioconductor.
S
SS
4·
Geprüft am 3. Sep. 2016
A nice course to introduce Bioconductor to students
Q
QZ
4·
Geprüft am 20. Mai 2018
It's very helpful in learning genomic data science. I think it's a little difficult in the beginning. The instructor have some accent, which made me even harder to get into it.
Wann werde ich Zugang zu den Vorlesungen und Aufgaben haben?
Um Zugang zu den Kursmaterialien und Aufgaben zu erhalten und um ein Zertifikat zu erwerben, müssen Sie die Zertifikatserfahrung erwerben, wenn Sie sich für einen Kurs anmelden. Sie können stattdessen eine kostenlose Testversion ausprobieren oder finanzielle Unterstützung beantragen. Der Kurs kann stattdessen die Option "Vollständiger Kurs, kein Zertifikat" anbieten. Mit dieser Option können Sie alle Kursmaterialien einsehen, die erforderlichen Bewertungen abgeben und eine Abschlussnote erhalten. Dies bedeutet auch, dass Sie kein Zertifikat erwerben können.
Was bekomme ich, wenn ich mich für diese Specialization einschreibe?
Wenn Sie sich für den Kurs einschreiben, erhalten Sie Zugang zu allen Kursen der Spezialisierung, und Sie erhalten ein Zertifikat, wenn Sie die Arbeit abgeschlossen haben. Ihr elektronisches Zertifikat wird Ihrer Seite "Leistungen" hinzugefügt - von dort aus können Sie Ihr Zertifikat ausdrucken oder Ihrem LinkedIn-Profil hinzufügen.
Ist finanzielle Hilfe verfügbar?
Ja. Für ausgewählte Lernprogramme können Sie finanzielle Unterstützung oder ein Stipendium beantragen, wenn Sie die Einschreibegebühr nicht aufbringen können. Wenn für das von Ihnen gewählte Lernprogramm eine finanzielle Unterstützung oder ein Stipendium verfügbar ist, finden Sie auf der Beschreibungsseite einen Link zur Beantragung.