Researcher's guide to DNA sequencing data

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Researcher's guide to DNA sequencing data

Dieser Kurs ist Teil von Spezialisierung „Researcher's Guide to Omic Data“

Dozent: Candace Savonen, MS

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Stufe Mittel

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6 Stunden zu vervollständigen

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Was Sie lernen werden

You will be able to understand the goals and general workflows of DNA based methods and know tools and resources you should consider.

Kompetenzen, die Sie erwerben

Kategorie: Analysis
Kategorie: Research Methodologies
Kategorie: Research
Kategorie: Biochemical Assays
Kategorie: Data Processing
Kategorie: Data Collection
Kategorie: Research Design
Kategorie: General Science and Research
Kategorie: Laboratory Techniques
Kategorie: Molecular Biology
Kategorie: Molecular, Cellular, and Microbiology
Kategorie: Bioinformatics
Kategorie: Science and Research

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This course is a follow up course to "Researcher's Guide to Fundamentals of Omic Data" which dives into further detail about DNA informatics methods!

This course is for individuals who: - Have taken Researcher's Guide to Fundamentals of Omic Data - Have DNA data and don’t know what to do with it. - Want a basic overview of their DNA focused data type. - Want to find resources for processing and interpreting DNA data What this course will cover: - Fundamentals of DNA methods. - Resources you may consider looking into for your own purposes. - Questions you should ask yourself and your colleagues about your goals and experimental design. What this course will NOT cover: - Code needed to process your data. - Details about every type of experimental design. - Everything you’d need to know to make you a computational biologist. In other words we still highly encourage you to consult your informatics and computational colleagues, especially those who may have done any handling of data you are trying to learn about.

In this module we discuss what this course covers and encourage you to make your own goals for what you'd like to learn. Then we start with some generalities about DNA focused methods.

Das ist alles enthalten

3 Videos3 Lektüren2 Aufgaben1 Diskussionsthema

3 VideosInsgesamt 6 Minuten

Welcome!1 Minute
Intro to this course1 Minute
DNA Overview4 Minuten

3 LektürenInsgesamt 19 Minuten

Considerations for your DNA goals5 Minuten
Video covering types of mutations2 Minuten
DNA Overview12 Minuten

2 AufgabenInsgesamt 11 Minuten

DNA Overview6 Minuten
DNA Overview5 Minuten

1 DiskussionsthemaInsgesamt 15 Minuten

Goals for this course15 Minuten

In this module we cover the details of whole genome sequencing and whole exome sequencing. We compare and contrast the methods and discuss what kinds of questions these data types might answer.

Das ist alles enthalten

2 Lektüren2 Aufgaben1 Diskussionsthema

In this section we dive into DNA methylation sequencing methods, also known more specifically as bisulfite sequencing.

Das ist alles enthalten

2 Lektüren2 Aufgaben1 Diskussionsthema

In this section we cover the basics of chromatin evaluation methods. We contrast and compare chromatin sequencing methods.

Das ist alles enthalten

1 Video2 Lektüren2 Aufgaben1 Diskussionsthema

In this module, we discuss details of the different ways chromatin can be assessed. We go through the basics of ATAC-seq, and scRNA-seq.

Das ist alles enthalten

2 Videos3 Lektüren2 Aufgaben

In this section we cover the basics of ChIP-seq and CUT & Tag and CUT & RUN.

Das ist alles enthalten

1 Video4 Lektüren2 Aufgaben

In this section, In this module we discuss when microarrays should be used for assaying DNA instead of sequencing methods. and then we will wrap up this course with a final quiz to assess your absorption of the material. We also point you to our Tool Glossary that has a list of tools you may want to consider for your next steps of your DNA omics study.

Das ist alles enthalten

3 Lektüren1 Aufgabe2 Diskussionsthemen

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Dozent

Candace Savonen, MS

Fred Hutchinson Cancer Center

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