Verschaffen Sie sich einen Einblick in ein Thema und lernen Sie die Grundlagen.
4.5
17 Bewertungen
Stufe Mittel
Empfohlene Erfahrung
Empfohlene Erfahrung
Stufe „Mittel“
Fortgeschrittene R-Kenntnisse. Einige Erfahrungen in der statistischen Programmierung und der Anwendung von CDISC-Standards in der pharmazeutischen Industrie wären hilfreich.
Verschaffen Sie sich einen Einblick in ein Thema und lernen Sie die Grundlagen.
4.5
17 Bewertungen
Stufe Mittel
Empfohlene Erfahrung
Empfohlene Erfahrung
Stufe „Mittel“
Fortgeschrittene R-Kenntnisse. Einige Erfahrungen in der statistischen Programmierung und der Anwendung von CDISC-Standards in der pharmazeutischen Industrie wären hilfreich.
Ziel dieses Kurses ist es, die Teilnehmer mit Open Source R-Paketen vertraut zu machen, die für die Berichterstattung über klinische Daten verwendet werden können. Der Schwerpunkt des Kurses liegt auf dem klinischen Datenfluss von Rohdaten (sowohl CRF als auch Nicht-CRF) zu SDTM zu ADaM zu den endgültigen Ergebnissen. Es werden zwar mehrere Open Source-Tools zur Erfüllung dieser Aufgaben vorgestellt, aber das Ziel dieses Kurses besteht nicht darin, ein Experte für eines dieser Tools zu werden, sondern vielmehr darin, den Teilnehmern die umfassenderen Konzepte hinter diesen Aufgaben näher zu bringen. Auf diese Weise dienen die Tools lediglich als Beispiel dafür, wie die zugrunde liegenden Konzepte in Code umgesetzt werden können.
In diesem Modul führen wir in den Kurs ein und geben einen kurzen Überblick über das, was Sie lernen werden. Wir erläutern den Kontext der klinischen Berichterstattung in R und die Motivation für die jüngste Trendwende in der Branche hin zur Unterstützung von Open Source-Tools. Wir werden die Herausforderungen der aktuellen statistischen Programmierpraxis und die Vorteile der Anwendung von Open Source-Tools beschreiben und zusätzliche Ressourcen zur Verfügung stellen, um mehr zu erfahren.
Das ist alles enthalten
1 Video1 Lektüre1 Diskussionsthema
Infos zu Modulinhalt anzeigen
1 Video•Insgesamt 2 Minuten
Willkommen bei Hands On Clinical Reporting Using R!•2 Minuten
1 Lektüre•Insgesamt 30 Minuten
Vorausgesetzte Lektüre: Warum Open Source-Tools?•30 Minuten
1 Diskussionsthema•Insgesamt 10 Minuten
Einführungen und Hintergrund•10 Minuten
Grundlagen
Modul 2•2 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In diesem Modul werden wir mehrere wichtige Themen im Zusammenhang mit klinischen Prüfungen der Phase 3 und klinischen Daten behandeln. Wir beginnen mit einer kurzen Einführung in Phase-3-Studien und besprechen die Art der Daten, die während dieser Studien gesammelt werden. Anschließend geben wir einen Überblick über zwei Datenmodelle, die üblicherweise für die Verarbeitung von Daten aus klinischen Studien verwendet werden, nämlich SDTM und ADaM. Als Nächstes werden wir uns mit der Vorbereitung eines Dateneinreichungspakets für Gesundheitsbehörden befassen, wobei der Schwerpunkt auf der Food and Drug Administration (FDA) in den Vereinigten Staaten liegt. Wir werden die Anforderungen und Richtlinien für die Einreichung von Daten aus klinischen Studien bei der FDA untersuchen. Zum Abschluss dieses Moduls fassen wir unser Verständnis des klinischen Datenflusses zusammen und heben die wichtigsten Punkte hervor, die wir während des Kurses behandelt haben.
Das ist alles enthalten
6 Videos1 Lektüre1 Aufgabe
Infos zu Modulinhalt anzeigen
6 Videos•Insgesamt 23 Minuten
Einführung Grundlagen•1 Minute
Klinische Studien der Phase 3 - Protokoll & SAP•6 Minuten
Datenerhebung - mit CRFs und anderen Mitteln•6 Minuten
CDISC SDTM- und ADaM-Normen•3 Minuten
FDA(U.S.) Einreichungspaket•5 Minuten
Klinischer Datenfluss: Von den Rohdaten zu den endgültigen Ergebnissen•2 Minuten
1 Lektüre•Insgesamt 60 Minuten
Das Datenpuzzle entschlüsseln: weitere Lektüre zu Datenerhebung, Standards und Gesundheitsbehörden•60 Minuten
1 Aufgabe•Insgesamt 30 Minuten
Klinische Studien entschlüsseln: Ein umfassendes Quiz zu SAP, Estimands und Datenstandards•30 Minuten
SDTM: Modell für die Tabellierung von Studiendaten
Modul 3•1 Stunde abzuschließen
Moduldetails
In diesem Modul werden wir eine Einführung in das Study Data Tabulation Model (oder SDTM) geben, indem wir den Kontext erläutern und die Bedeutung solcher Datenmodelle für klinische Studien hervorheben. Wir werden verschiedene SDTM-Datenzuordnungen für CRF- und Nicht-CRF-Daten untersuchen. Schließlich geben wir einen Ausblick auf die Programmierung von SDTMs in R.
Das ist alles enthalten
4 Videos1 Aufgabe
Infos zu Modulinhalt anzeigen
4 Videos•Insgesamt 29 Minuten
Einführung SDTM•1 Minute
Kontext und Arbeitsablauf•10 Minuten
SDTM-Datenzuordnung•13 Minuten
Programmierung von SDTM•5 Minuten
1 Aufgabe•Insgesamt 20 Minuten
SDTM meistern: Ein Quiz über Studiendatenstandards und Implementierung•20 Minuten
ADaM-Transformationen (einführend)
Modul 4•5 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In diesem Modul untersuchen wir, was Analysedatenmodelle (ADaM) sind, die 3 Strukturen von ADaM und wie man ADaM in R mit Pharmaverse-Paketen erstellt.
Das ist alles enthalten
16 Videos4 Lektüren4 Aufgaben
Infos zu Modulinhalt anzeigen
16 Videos•Insgesamt 62 Minuten
Einführung•1 Minute
Was ist ADaM?•2 Minuten
Struktur des Analysedatensatzes auf Fachebene (ADSL)•2 Minuten
Datenstruktur für Vorkommnisse (OCCDS)•3 Minuten
Grundlegende Datenstruktur (BDS)•4 Minuten
Die Vision•2 Minuten
admiral und pharmaverse für ADaM-Entwicklung•3 Minuten
Speicherung und Verwendung von ADaM-Metadaten•2 Minuten
Teil 1 - Metacore-Objekt•8 Minuten
Teil 2 - Metacore-Objekt•5 Minuten
Teil 3 - Metacore-Objekt•4 Minuten
QCing und Export von ADaM•3 Minuten
Teil 1 - ADSL-Demo•11 Minuten
Teil 2 - ADSL-Demo•8 Minuten
Teil 3 - ADSL-Demo•3 Minuten
Modul-Überprüfung•1 Minute
4 Lektüren•Insgesamt 90 Minuten
Ergänzende Ressourcen zum Verständnis der ADaM-Normen in der Industrie•60 Minuten
Links zu Pharmaverse Github Repos und Websites•10 Minuten
Links zur ADaM-Dokumentation und den Github-Repos für den in den Demos verwendeten Code•10 Minuten
Quiz-Ressourcen•10 Minuten
4 Aufgaben•Insgesamt 120 Minuten
Modul Quiz - ADaM-Transformationen (einführend) mit Pharmaverse R-Paketen•60 Minuten
Lektion Eins - Testen Sie Ihr Wissen•20 Minuten
Lektion Zwei - Testen Sie Ihr Wissen•20 Minuten
Lektion Drei - Testen Sie Ihr Wissen•20 Minuten
ADaM-Transformationen (Fortgeschrittene)
Modul 5•7 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In diesem Modul werden wir ADaM und R unter Verwendung der Pharmaverse-Pakete einen Schritt weiter erforschen. Wir konzentrieren uns auf die ADaM Occurence Data Structure, bekannt als OCCDS, anhand des Beispiels Analysis Dataset Adverse Events (ADAE). Wir gehen darauf ein, was eine OCCDS ist, was unerwünschte Ereignisse sind und wie man ADAE mit {admiral} und anderen R Pharmaverse-Paketen erstellt. AS Sie dieses Training mit einem praktischen Ansatz durchlaufen, folgen Sie bitte zuerst den Installationsanweisungen hier, um sicherzustellen, dass Sie dieselbe R-Version und dieselben R-Pakete verwenden, die sowohl für das Training als auch für das Quiz am Ende benötigt werden. Sie können die Schritte 1-6 jetzt ausführen: https://www.coursera.org/learn/hands-on-clinical-reporting-using-r/supplement/enxGp/adae-quiz-resources (bei Bedarf kopieren und einfügen), dann fahren Sie mit dem Training fort. Sobald Sie zum Quiz kommen, können Sie mit Schritt 7 beginnen.
Das ist alles enthalten
36 Videos2 Lektüren8 Aufgaben
Infos zu Modulinhalt anzeigen
36 Videos•Insgesamt 180 Minuten
Einführung in OCCDS und ADAE•1 Minute
ADAE-Schulungsübersicht•5 Minuten
Was Sie in Sitzung 1 erwartet•2 Minuten
Hintergrund zu unerwünschten Ereignissen•2 Minuten
R-Pakete, Tools und Ressourcen für diese Schulung.•1 Minute
Erste Schritte bei der Programmierung von ADAE in R•1 Minute
Lassen Sie uns die Quelldaten einlesen•4 Minuten
Umwandlung von Leerzeichen in Werte nach NA•4 Minuten
Zusammenführung in ADSL-Variablen•5 Minuten
Ableitung des Datums für den Beginn des unerwünschten Ereignisses•5 Minuten
Ableitung der Endzeit des unerwünschten Ereignisses•5 Minuten
Relative Tage einer SAR ab der ersten Exposition gegenüber dem Studienmedikament•3 Minuten
AE Laufzeiten•4 Minuten
Was Sie in Sitzung 4 erwartet•1 Minute
Letzte Dosis datetime•6 Minuten
Überprüfung der Ableitung des Datums der letzten Dosis•7 Minuten
Schweregrad und Kausalität•3 Minuten
Was wird in dieser Sitzung behandelt?•3 Minuten
Kennzeichnung behandlungsbedingter SARs•8 Minuten
Fenster "Behandlung-Emergent Flag•6 Minuten
Kennzeichnung von AE-Ereignissen•12 Minuten
Was sind Standard-MedDRA-Abfragen (SMQs) und benutzerdefinierte Abfragen (CQs)?•6 Minuten
Ableitung von Standard-MedDRA-Abfragen (SMQs) und benutzerdefinierten Abfragen (CQs)•17 Minuten
Was Sie in Sitzung 6 erwartet•3 Minuten
Hinzufügen von ADSL-Variablen•8 Minuten
Ableitung der Analysesequenz•8 Minuten
Einlesen Ihrer ADaM-Spezifikationen•7 Minuten
Überprüfung der Variablen zwischen Ihrem Datensatz und den Spezifikationen•14 Minuten
Entfernen nicht benötigter Variablen aus Ihrem Datensatz•4 Minuten
Ordnen von Variablen in Ihrem Datensatz•3 Minuten
Sortieren Ihres Datensatzes nach dem Sortierschlüssel gemäß Ihren Angaben•4 Minuten
Attribute mit variabler Länge•5 Minuten
Variable Label-Attribute•3 Minuten
Kontrollierte Terminologieprüfungen•6 Minuten
Abschließende XPT-Prüfung und Konvertierung•6 Minuten
Modul-Überprüfung•2 Minuten
2 Lektüren•Insgesamt 20 Minuten
Anweisungen zur Installation der R-Umgebung für die kommenden Schulungsdemos.•10 Minuten
ADAE-Quiz-Ressourcen•10 Minuten
8 Aufgaben•Insgesamt 220 Minuten
Quiz - ADaM-Transformationen (Fortgeschrittene) mit Pharmaverse R-Paketen•120 Minuten
Lektion 1: Testen Sie Ihr Wissen•15 Minuten
Lektion 2: Testen Sie Ihr Wissen•15 Minuten
Lektion 3: Testen Sie Ihr Wissen•15 Minuten
Lektion 4: Testen Sie Ihr Wissen•15 Minuten
Lektion 5: Testen Sie Ihr Wissen•15 Minuten
Lektion 6a: Testen Sie Ihr Wissen•10 Minuten
Lektion 6b: Testen Sie Ihr Wissen•15 Minuten
Statische TLGs (NEST)
Modul 6•4 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In diesem Modul werden die Konzepte zur Erstellung von Ausgaben für regulatorische Zwecke und insbesondere die NEST-Pakete vorgestellt. Wir zeigen, wie Sie NEST effektiv nutzen können, um Ihre Tabellen, Listen und Diagramme (TLGs) während der klinischen Berichterstattung zu erstellen und anzupassen, und stellen den TLG-Katalog vor, der die Erstellung von Ausgaben mit unseren Paketen unterstützt. Wir erläutern die Vorteile von Open Source und die Bemühungen der Industrie zur Zusammenarbeit bei der klinischen Berichterstattung.
Das ist alles enthalten
36 Videos2 Aufgaben
Infos zu Modulinhalt anzeigen
36 Videos
Erstellung statischer TLGs für die klinische Berichterstattung mit R•0 Minuten
Lektion 1: Einführung und Konzepte•0 Minuten
Grundlegende Konzepte der TLGs•0 Minuten
Wie wird entschieden, welche TLGs benötigt werden?•0 Minuten
Stadien der TLG-Entwicklung•0 Minuten
Einführung in NEST•0 Minuten
Schlüsselpakete für die TLG-Entwicklung•0 Minuten
Lektion 1 Überblick•0 Minuten
Einführung in Lektion 2•0 Minuten
Einführung in das Tern-Paket•0 Minuten
Tern-Analysefunktionen•0 Minuten
Was ist rtables?•0 Minuten
Konzept der rTabellen•0 Minuten
Einführung in Demonstrationen•0 Minuten
Tabelle Demografie•0 Minuten
Begehung der Demografietabelle•0 Minuten
Demografietabelle Schlussfolgerung•0 Minuten
Einführung in die Tabelle der unerwünschten Ereignisse•0 Minuten
Begehung von unerwünschten Ereignissen•0 Minuten
Zusammenfassung der Tabelle der unerwünschten Ereignisse•0 Minuten
Antworttabelle Einleitung•0 Minuten
Antworttabelle - Vorverarbeitung der Daten•0 Minuten
Bemühungen um Zusammenarbeit mit der Industrie•0 Minuten
2 Aufgaben•Insgesamt 210 Minuten
Quiz - Erstellen statischer TLGs mit NEST-Paketen•30 Minuten
Lektion 2 Quiz - Erstellen statischer TLGs mit NEST•180 Minuten
Interaktive Datenanzeigen
Modul 7•2 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In diesem Modul werden wir die Vorteile der Verwendung interaktiver Datenanzeigen für die klinische Berichterstattung diskutieren. Wir werden die Teal-Familie von R-Paketen vorstellen und uns mit den wichtigsten Funktionen vertraut machen, die dieses Framework bietet. Schließlich lernen wir, wie man eine interaktive Anwendung auf Produktionsebene entwickelt, die Teal-Module für Datenüberprüfung, Sicherheits- und Wirksamkeitsanalysen verwendet.
Das ist alles enthalten
26 Videos1 Lektüre4 Aufgaben
Infos zu Modulinhalt anzeigen
26 Videos•Insgesamt 80 Minuten
Motivation für interaktive Datenanzeigen•4 Minuten
Einführung•1 Minute
Was ist Krickente?•3 Minuten
Teal-Demo•8 Minuten
Die wichtigsten Merkmale von Teal•2 Minuten
Wie funktioniert Teal?•1 Minute
Demo-Module mit teal.gallery•1 Minute
Teal als Datenwissenschaftler verwenden•1 Minute
Einführung•0 Minuten
Anleitung zur Installation von Teal•1 Minute
Arbeitsablauf bei der App-Entwicklung•1 Minute
Einrichtung des App-Projekts•4 Minuten
Erste Tee-App•4 Minuten
Filter in aquamarin•2 Minuten
Erweiterte Filter•4 Minuten
Einführung•1 Minute
Arbeitsablauf bei der Entwicklung von Teal-Anwendungen•1 Minute
Module zur Datenüberprüfung•7 Minuten
Daten laden•1 Minute
Reproduzierbarkeit des Codes•5 Minuten
Verarbeitung von Eingabedaten•4 Minuten
Hinzufügen eines Moduls für eine demografische Tabelle•4 Minuten
Hinzufügen eines Moduls für eine Tabelle der unerwünschten Ereignisse•6 Minuten
Hinzufügen eines KM-Plot-Moduls•7 Minuten
Erstellen Sie die vollständige Anwendung•4 Minuten
Überprüfung der Module•4 Minuten
1 Lektüre•Insgesamt 5 Minuten
Teal Universum Produktkarte•5 Minuten
4 Aufgaben•Insgesamt 60 Minuten
Quiz zur Modulbewertung•30 Minuten
Quiz über den Teerahmen•10 Minuten
Quiz zu den Grundbegriffen von Teal•10 Minuten
Quiz über fortgeschrittene Konzepte von Teal•10 Minuten
Fazit
Modul 8•3 Minuten abzuschließen
Moduldetails
In diesem letzten Modul werden wir den Kurs kurz Revue passieren lassen und Vorschläge für die nächsten Schritte auf Ihrer Lernreise machen.
Wann werde ich Zugang zu den Vorlesungen und Aufgaben haben?
Um Zugang zu den Kursmaterialien und Aufgaben zu erhalten und um ein Zertifikat zu erwerben, müssen Sie die Zertifikatserfahrung erwerben, wenn Sie sich für einen Kurs anmelden. Sie können stattdessen eine kostenlose Testversion ausprobieren oder finanzielle Unterstützung beantragen. Der Kurs kann stattdessen die Option "Vollständiger Kurs, kein Zertifikat" anbieten. Mit dieser Option können Sie alle Kursmaterialien einsehen, die erforderlichen Bewertungen abgeben und eine Abschlussnote erhalten. Dies bedeutet auch, dass Sie kein Zertifikat erwerben können.
Was erhalte ich, wenn ich das Zertifikat kaufe?
Wenn Sie ein Zertifikat erwerben, erhalten Sie Zugang zu allen Kursmaterialien, einschließlich der benoteten Aufgaben. Nach Abschluss des Kurses wird Ihr elektronisches Zertifikat zu Ihrer Erfolgsseite hinzugefügt - von dort aus können Sie Ihr Zertifikat ausdrucken oder zu Ihrem LinkedIn-Profil hinzufügen.
Ist finanzielle Hilfe verfügbar?
Ja. Für ausgewählte Lernprogramme können Sie finanzielle Unterstützung oder ein Stipendium beantragen, wenn Sie die Einschreibegebühr nicht aufbringen können. Wenn für das von Ihnen gewählte Lernprogramm eine finanzielle Unterstützung oder ein Stipendium verfügbar ist, finden Sie auf der Beschreibungsseite einen Link zur Beantragung.