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Lernen Sie neue Konzepte von Branchenexperten
Gewinnen Sie ein Grundverständnis bestimmter Themen oder Tools
Erwerben Sie berufsrelevante Kompetenzen durch praktische Projekte
Erwerben Sie ein Berufszertifikat zur Vorlage
In diesem Kurs gibt es 4 Module
Neurohacking beschreibt, wie Sie die Programmiersprache R (https://cran.r-project.org/) und die dazugehörigen Pakete zur Manipulation, Verarbeitung und Analyse von Neuroimaging-Daten verwenden können. Wir konzentrieren uns auf öffentlich zugängliche strukturelle Magnetresonanztomographie (MRI). Wir besprechen Konzepte wie Inhomogenitätskorrektur, Bildregistrierung und Bildvisualisierung. Am Ende dieses Kurses werden Sie in der Lage sein: Bilder des Gehirns im NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative)-Format zu lesen/schreiben diese Bilder zu visualisieren und zu erforschen Inhomogenitätskorrektur, Gehirnextraktion und Bildregistrierung (innerhalb eines Subjekts und zu einer Vorlage) durchzuführen.
Das ist alles enthalten
3 Videos1 Lektüre1 Aufgabe
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3 Videos•Insgesamt 30 Minuten
Treffen Sie das Team•7 Minuten
Einführung•12 Minuten
Strukturelle MRT und R•12 Minuten
1 Lektüre•Insgesamt 10 Minuten
Syllabus•10 Minuten
1 Aufgabe•Insgesamt 30 Minuten
Thema 1 Quiz•30 Minuten
Neuroimaging: Formate und Visualisierung
Modul 2•4 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In diesem Abschnitt besprechen wir die verschiedenen Formate, in denen Bilder des Gehirns vorliegen, sowie einige der am häufigsten durchgeführten Magnetresonanztomographien (MRT).
Das ist alles enthalten
7 Videos6 Aufgaben
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7 Videos•Insgesamt 74 Minuten
Datenstrukturen und Operationen•12 Minuten
Das NIfTI-Format•10 Minuten
Grundlegende Visualisierung 1•9 Minuten
Grundlegende Visualisierung 2•10 Minuten
Grundlegende Datenmanipulation•10 Minuten
Transformationen und Glättung•15 Minuten
Grundlegende MRT-Kontrastmittel•9 Minuten
6 Aufgaben•Insgesamt 180 Minuten
Thema 2 Vorlesung 1 Quiz•30 Minuten
Thema 2 Vorlesung 2 Quiz•30 Minuten
Thema 2 Vorlesung 3 Quiz•30 Minuten
Thema 2 Vorlesung 4 Quiz•30 Minuten
Thema 2 Vorlesung 5 Quiz•30 Minuten
Thema 2 Vorlesung 6 Quiz•30 Minuten
Bildbearbeitung
Modul 3•6 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In diesem Abschnitt werden wir die Schritte zur Verarbeitung von MRT-Daten des Gehirns besprechen. Wir werden die Inhomogenitätskorrektur, die Extraktion des Gehirns oder das Strippen des Schädels und verschiedene Bildregistrierungstechniken diskutieren.
Das ist alles enthalten
9 Videos9 Aufgaben
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9 Videos•Insgesamt 71 Minuten
Vorverarbeitung: Ein Überblick•14 Minuten
Anmeldung•15 Minuten
fslr: Systemanforderungen•9 Minuten
Biasfeld-Korrektur mit fslr•4 Minuten
Gehirn-Extraktion mit fslr•6 Minuten
Bildregistrierung mit fslr•6 Minuten
ANTsR installieren•5 Minuten
Grundlegende Datenmanipulation mit ANTsR•5 Minuten
Vorverarbeitung mit ANTSR•8 Minuten
9 Aufgaben•Insgesamt 270 Minuten
Thema 3 Quiz 1•30 Minuten
Thema 3 Quiz 2•30 Minuten
Thema 3 Quiz 3•30 Minuten
Thema 3 Quiz 4•30 Minuten
Thema 3 Quiz 5•30 Minuten
Thema 3 Quiz 6•30 Minuten
Thema 3 Quiz 7•30 Minuten
Thema 3 Quiz 8•30 Minuten
Thema 3 Quiz 9•30 Minuten
Erweiterte Bildverarbeitung
Modul 4•7 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In diesem Abschnitt besprechen wir die verschiedenen Arten der Registrierung und wie man bei der Verarbeitung eines MRT-Scans mit mehreren Sequenzen vorgeht, sowie Wrapper-Funktionen, die den Prozess erheblich vereinfachen. Wir behandeln auch die interaktive Erkundung von Gehirnbilddaten und die Segmentierung auf Gewebeebene (weiße/graue Substanz und Liquor) aus einem T1-gewichteten Bild.
Das ist alles enthalten
11 Videos1 Lektüre10 Aufgaben
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11 Videos•Insgesamt 101 Minuten
Fortgeschrittene Bildverarbeitung des Gehirns•5 Minuten
Co-Registrierung mit fslr•9 Minuten
Ko-Registrierung mit ANTsR•10 Minuten
Wrapper-Funktionen für Verarbeitungspipelines•8 Minuten
Besuchsübergreifende Co-Registrierung von T1-Bildern•6 Minuten
Starre Registrierung in einer Vorlage•8 Minuten
Affine Registrierung von T1 auf Vorlage•4 Minuten
Nichtlineare Registrierung von T1 zur Vorlage•7 Minuten
ROI Anatomische Informationen aus nicht-linearer Registrierung erhalten•13 Minuten
Segmentierung auf Gewebsebene•7 Minuten
Papayar: Interaktives Betrachten von Bildern in R•23 Minuten
1 Lektüre•Insgesamt 10 Minuten
Papayar Schrift•10 Minuten
10 Aufgaben•Insgesamt 300 Minuten
Thema 4 Quiz 1•30 Minuten
Thema 4 Quiz 2•30 Minuten
Thema 4 Quiz 3•30 Minuten
Thema 4 Quiz 4•30 Minuten
Thema 4 Quiz 5•30 Minuten
Thema 4 Quiz 6•30 Minuten
Thema 4 Quiz 7•30 Minuten
Thema 4 Quiz 8•30 Minuten
Thema 4 Quiz 9•30 Minuten
Thema 4 Quiz 10•30 Minuten
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Dozenten
Lehrkraftbewertungen
Lehrkraftbewertungen
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Die Aufgabe der Johns Hopkins University ist es, ihre Studenten auszubilden und ihre Fähigkeit zum lebenslangen Lernen zu fördern, unabhängige und originelle Forschung zu betreiben und der Welt den Nutzen von Entdeckungen zu bringen.
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Ja. Für ausgewählte Lernprogramme können Sie finanzielle Unterstützung oder ein Stipendium beantragen, wenn Sie die Einschreibegebühr nicht aufbringen können. Wenn für das von Ihnen gewählte Lernprogramm eine finanzielle Unterstützung oder ein Stipendium verfügbar ist, finden Sie auf der Beschreibungsseite einen Link zur Beantragung.