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In diesem Kurs gibt es 5 Module
Dieser Kurs zielt darauf ab, die Konzepte klinischer Datenmodelle und gängiger Datenmodelle zu vermitteln. Nach Abschluss dieses Kurses sind die Teilnehmer in der Lage, Datenmodelldesigns mithilfe von Entity-Relationship-Diagrammen (ERDs) zu interpretieren und zu bewerten, zwischen Datenmodellen zu unterscheiden und darzulegen, wie diese zur Unterstützung der klinischen Versorgung und der Datenwissenschaft eingesetzt werden, und SQL-Anweisungen in Google BigQuery zu erstellen, um das klinische Datenmodell MIMIC3 und das gemeinsame Datenmodell OMOP abzufragen.
In dieser Woche werden klinische Datenmodelle beschrieben und der Bedarf an und die Verwendung von gemeinsamen Datenmodellen in nationalen und internationalen Datennetzen erläutert. Wir werden auch die Merkmale von Entity-Relationship-Diagrammen (ERDs) behandeln, um die wichtigsten technischen Merkmale von Datenmodellen zu beschreiben.
Das ist alles enthalten
9 Videos5 Lektüren1 Aufgabe
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9 Videos•Insgesamt 54 Minuten
Willkommen bei den klinischen Datenmodellen und der Bewertung der Datenqualität•2 Minuten
Data Warehouses für die klinische Forschung•9 Minuten
Entity-Relationship-Diagramme (ERDs)•4 Minuten
Klinische Datenmodelle•4 Minuten
Warum gemeinsame Datenmodelle?•10 Minuten
Ein kurzer Rundgang durch ein gemeinsames Datenmodell: i2b2•7 Minuten
Ein kurzer Rundgang durch ein gemeinsames Datenmodell: OMOP•6 Minuten
Ein kurzer Rundgang durch ein gemeinsames Datenmodell: Sentinel•6 Minuten
Ein kurzer Rundgang durch ein gemeinsames Datenmodell: PCORNet•6 Minuten
5 Lektüren•Insgesamt 150 Minuten
Holen Sie sich Hilfe und treffen Sie andere Lernende in diesem Kurs. Treten Sie Ihren Diskussionsforen bei!•5 Minuten
Einführung in die Specializations Instruktoren•5 Minuten
Kursrichtlinien•5 Minuten
Zugriff auf Kursdaten und Technologieplattform•15 Minuten
Lektüre und Kursmaterialien für Modul 1•120 Minuten
1 Aufgabe•Insgesamt 30 Minuten
Klinische Datenmodelle und gemeinsame Datenmodelle•30 Minuten
Werkzeuge: Abfrage klinischer Datenmodelle
Modul 2•3 Stunden abzuschließen
Moduldetails
Wir tauchen tief in die technischen Merkmale von klinischen Datenmodellen am Beispiel von MIMIC3 ein und untersuchen gängige Datenmodelle am Beispiel von OMOP.
Das ist alles enthalten
6 Videos1 Lektüre1 Aufgabe
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6 Videos•Insgesamt 59 Minuten
Ein tiefer Einblick in das MIMIC-III-Datenmodell•5 Minuten
MIMIC-III abfragen•10 Minuten
Ein tiefer Einblick in das OMOP-Datenmodell•14 Minuten
OMOP abfragen•12 Minuten
Vergleich der Datenmodelle MIMIC und OMOP•11 Minuten
Das Ökosystem der OHDSI-Gemeinschaft•7 Minuten
1 Lektüre•Insgesamt 90 Minuten
Lektüre und Kursmaterialien für Modul 2•90 Minuten
Techniken: Extrahieren-Transformieren-Laden und Terminologie-Mapping
Modul 3•3 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In diesem Modul lernen Sie die Prozesse und Herausforderungen beim Extrahieren, Transformieren und Laden (ETL) von Daten anhand von praktischen Beispielen aus der Daten- und Terminologiezuordnung kennen.
Das ist alles enthalten
6 Videos1 Lektüre1 Aufgabe
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6 Videos•Insgesamt 53 Minuten
Die ETL-Aufgabe•7 Minuten
Strukturelles versus terminologisches Mapping•6 Minuten
Datenprofilierung mit White Rabbit•10 Minuten
Daten-Mapping mit dem Tool Rabbit in a Hat•9 Minuten
Terminologie Mapping•11 Minuten
Beispiel für die Zuordnung von MIMIC Patient zu OMOP Person•9 Minuten
1 Lektüre•Insgesamt 120 Minuten
Lektüre und Kursmaterialien für Modul 3•120 Minuten
1 Aufgabe•Insgesamt 30 Minuten
Techniken: Extrahieren-Transformieren-Laden und Terminologie-Mapping•30 Minuten
Techniken: Bewertungen der Datenqualität
Modul 4•3 Stunden abzuschließen
Moduldetails
Wir untersuchen die Dimensionen der Datenqualität, indem wir ihre Herausforderungen, die zu ihrer Messung verwendeten Datenqualitätsmessungen und die Regeln für die Datenqualität zur Beurteilung ihrer Verwendbarkeit untersuchen.
Das ist alles enthalten
5 Videos1 Lektüre1 Aufgabe
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5 Videos•Insgesamt 52 Minuten
Dimensionen der Datenqualität / Gebrauchstauglichkeit•7 Minuten
Datenprofilierung zur Bewertung der Datenqualität•10 Minuten
Bewertung der Datenqualität mit SQL•13 Minuten
Callahan und Khare Regeln•9 Minuten
OHDSI Achillesferse und Achillesferse•13 Minuten
1 Lektüre•Insgesamt 90 Minuten
Lektüre und Kursmaterialien für Modul 4•90 Minuten
1 Aufgabe•Insgesamt 30 Minuten
Techniken: Bewertungen der Datenqualität•30 Minuten
Praktische Anwendung: Erstellen eines ETL-Prozesses zur Umwandlung einer MIMIC-III-Tabelle in OMOP
Modul 5•4 Stunden abzuschließen
Moduldetails
In diesem Modul sammeln Sie alles, was Sie gelernt haben, um eine praktische Übung mit ETL-Methoden zur Konvertierung von MIMIC3-Daten in das gemeinsame OMOP-Datenmodell durchzuführen.
Das ist alles enthalten
6 Videos1 Lektüre1 peer review
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6 Videos•Insgesamt 43 Minuten
Überprüfung des ETL-Prozesses•6 Minuten
Beispiel: Umwandlung eines MIMIC-Patienten in eine OMOP-Person - Schritte 1 und 2•5 Minuten
Beispiel: MIMIC-Patient in OMOP-Person umwandeln Schritt3•10 Minuten
Beispiel: MIMIC-Patient in OMOP-Person umwandeln Schritt 4•8 Minuten
Beispiel: Umwandlung eines MIMIC-Patienten in eine OMOP-Person Schritt 5 und 6•11 Minuten
Beispiel: MIMIC-Patient in OMOP-Person umwandeln Schritt 7•4 Minuten
1 Lektüre•Insgesamt 10 Minuten
Willkommen bei Practical Applications!•10 Minuten
1 peer review•Insgesamt 210 Minuten
Praktisches Anwendungsprojekt: Erstellen eines ETL-Prozesses zur Umwandlung einer MIMIC-III-Tabelle in OMOP•210 Minuten
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Dozenten
Lehrkraftbewertungen
Lehrkraftbewertungen
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Die University of Colorado ist auf nationaler und globaler Ebene ein anerkannter Marktführer im Bereich der Hochschulbildung. Wir arbeiten zusammen, um die vielfältigen Bedürfnisse unserer Studenten und Gemeinschaften zu erfüllen. Wir fördern Innovationen, ermutigen zu Entdeckungen und unterstützen die Erweiterung des Wissens auf eine Art und Weise, die für den Staat Colorado und darüber hinaus einzigartig ist.
Wann werde ich Zugang zu den Vorlesungen und Aufgaben haben?
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